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📚 2026年5月 月次論文レビュー — 💊 メディシナルケミストリー

対象期間: 2026-05-01 〜 2026-05-31 このページ: 1〜10 件目 各ボタンは独立したトグル(複数同時ON可)
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1. Wee1-targeting inhibitors: From virtual screening to lead discovery▶ スライドあり
DOI: 10.1016/j.bmc.2026.118645 · 📅 2026年3月 (Bioorganic & Medicinal Chemistry, Vol. 138) · メディシナルケミストリー
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UCAM Murcia の BIO-HPC グループ、Eurofins-Villapharma、Eurofins Discovery、ミネソタ大学の連携チームによる、抗がん標的 Wee1 の阻害薬リード発見論文である。Wee1 は Ser/Thr キナーゼで G2/M チェックポイントを担い、p53 欠損細胞を premature mitosis に追い込むことで化学療法・放射線療法と相乗効果を出す。代表的臨床候補 MK-1775 (adavosertib) は Phase III まで進んだが承認薬は未だなく、毒性・選択性の改善余地が大きい。本研究は社内ライブラリから始まる完全な hit-to-lead パイプラインを記述しており、…
📣 UCAMとEurofinsチームによるWee1阻害薬リード発見。社内ライブラリのVS+Gnina+PLIP+500ns MDでCompound 20 (IC50=33 nM)を取得。ortho双Cl置換のhalogen bondとASP463水架橋がpotency鍵。MK-177
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2. Cyclic peptides in modern drug discovery: trends and therapeutic directions▶ スライドあり
DOI: 10.26434/chemrxiv.15002351 · 📅 2026年4月 · メディシナルケミストリー
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ThiteらACS International India・CAS(American Chemical Society)の共同チームが、世界最大の人手キュレーション科学文書データベースCAS Content Collectionの2006〜2025年分(論文・特許合計約23,471件)を分析し、環状ペプチドの研究トレンドと治療方向性を網羅的にまとめたデータドリブンレビューである。 CAS REGISTRY から46,574件の環状ペプチド(CASロール: 治療薬/薬理的/薬物動態的なもの)をRDKitによるSMILES解析で抽出し、環化タイプ・環サイズ・化学修飾・投与経路・適応疾患・出版地域・主要研究機関・引用影響度を統合的に分析した。
📣 CAS Collection 46,574件の環状ペプチドをデータ解析。head-to-tail大環状が主流、経口投与への関心急増。腫瘍・感染症が主要適応。2032年市場53億ドル超予測。計算創薬加速のデザイン指針を提供。
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3. Discovery of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Small-Molecule Inhibitors of CDK8 for the Treatment of Cancer▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.2c01718 · 📅 2023年4月(J. Med. Chem. 2023, 66, 5439–5452) · メディシナルケミストリー
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CDK8(サイクリン依存性キナーゼ8)はMediator複合体のキナーゼサブユニットとしてRNA Pol II 依存性転写を制御し、WNT/β-catenin・Notch・p53・TGF-β等の複数の発がんシグナル経路を調節する。AML・大腸癌・黒色腫・膵臓癌など複数のがん種でオンコジーンとして機能することが報告されており、正常細胞に対する毒性プロファイルは許容範囲にある(CDK8枯渇は正常細胞増殖に影響しない)ことから、魅力的ながん治療標的とされる。本研究は Insilico Medicine(Zhavoronkov グループ)のAI創薬プラットフォーム Chemistry42 を用いた構造ベース生成化学で azaindole 系ヒット化合物 1(CDK8 IC50: 0.
📣 CDK8阻害剤:Chemistry42生成化学でazaindoleヒット(IC50 0.4nM)→SBDD最適化で化合物23(経口BA 87.4%)へ。AML CDXモデルで3mpk BID TGI 84.8%とRVU120を上回る優れた抗腫瘍効果。
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4. Discovery of Potent, Selective, CNS-Penetrant Macrocyclic LRRK2 Inhibitors for the Treatment of Parkinson's Disease▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.6c00238 · 📅 2026年3月(J. Med. Chem. 2026, 69, 8548–8560) · メディシナルケミストリー
判断:
LRRK2(leucine-rich repeat kinase 2)の遺伝子変異、特に G2019S 変異はパーキンソン病(PD)の最多遺伝的リスク因子であり、キナーゼ活性の亢進を引き起こす。Merck & Co.(Rahway)グループが既報の aminoquinazoline(AQ)系リード化合物 24 と amidoisoquinoline(IQ)系 MK-1468 から得た知見をマクロ環化戦略に発展させた研究で、type I ATP 競合的 LRRK2 阻害剤シリーズを構築した。マクロ環化が極性マスキング(EPSA 低下)と P-gp 基質回避に有効であることを実証し、最終リード化合物 12(projected human QD dose 34 mg、rat Kpu,u = 0.
📣 マクロ環LRRK2阻害剤:マクロ環化がEPSA低減→P-gp排出抑制でCNS透過性向上。化合物12は非遺伝毒性・34mg QD・rat Kpu,u=0.5を達成。PDの疾患修飾治療に向けた高品質ツール化合物。
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5. OpenBind's first release: A structure-affinity dataset for structure-based AI▶ スライドあり
DOI: 10.5281/zenodo.20026661 (Zenodo) · 📅 2026-05-05 (OpenBind blog / openbind.uk) · メディシナルケミストリー
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OpenBind は構造ベース機械学習モデルの性能をボトルネックにしているのは"アーキテクチャの新規性"ではなく"高品質な実験データの不足"であるという立場を明確に取り、protein-ligand 系の dense・high-quality・public な dataset を継続的に公開していくことを目指すコンソーシアムである。今回の最初のリリースでは、新興感染症で公衆衛生上重要な Enterovirus A71 (EV-A71) の 2A protease を選び、925 件の crystallographic binding events、699 化合物のリガンド構造、601 化合物の affinity 測定値を一斉に公開した。
📣 OpenBind が EV-A71 2A protease の高密度 dataset を公開: 925 結晶構造 + 699 化合物 + 601 affinity。構造ベース AI 向けの benchmark に直結し、cofolding/docking/affinity の弱点
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6. Design and Implementation of a High-Throughput Experimentation Platform to Accelerate Drug Discovery▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5c00814 · 📅 2025年10月(J. Med. Chem. 2025, 68, 21999–22008) · メディシナルケミストリー
判断:
AbbVieのDiscovery Chemistry部門(Advanced Chemistry Technologies: ACT group)が2017年以降8年間で構築・運用したHTE(High-Throughput Experimentation)プラットフォームの全体像を報告するPerspective論文。プロセスケミストリー向けが主流だったHTEをメディシナルケミストリーの探索段階に適用するため、ChemBeads(固体試薬をサブミリグラムスケールで分注可能なコーティングビーズ技術)を独自開発し、多様性重視のプレート設計・標準化ワークフロー・一元的ソフトウェア管理を確立した。
📣 AbbVie HTE 5年・800+スクリーン実績論文。ChemBeadsで固体試薬1μmol分注を実現。C−N結合67%/Suzuki78%/C−O結合55%成功率。BrettPhos Pd G3+LiHMDSがC−N最優秀。将来はBO+MLで自動最適化へ。#Medicinal
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7. Design, Synthesis, and Pharmacological Evaluation of Second-Generation Soluble Adenylyl Cyclase (sAC, ADCY10) Inhibitors with Slow Dissociation Rates▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.2c01133 · 📅 2022年11月(J. Med. Chem. 2022, 65, 15208–15226) · メディシナルケミストリー
判断:
sAC(soluble adenylyl cyclase、ADCY10)は細胞内cAMPシグナルを産生する酵素で、精子の運動性や先体反応に必須の役割を果たす。その遺伝子破壊マウスおよび変異ヒト2例では雄特異的不妊が観察されており、sAC阻害が非ホルモン性男性避妊薬の標的として注目されている。本論文は先代化合物TDI-10229を出発点に、構造ベース設計・FEP+・SPR速度論計測を組み合わせ、100倍以上のresidence time延長(25秒→3181秒)を達成したTDI-11861(compound 33)の発見を報告する。
📣 sAC阻害剤TDI-11861: residence time 25秒→3181秒(100倍延長)。Asp99新規H-bond+ortho-モルフォリン設計で KD=1.4nM達成。非ホルモン性男性避妊への道。JMedChem2022
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8. Structure-Activity Relationship Analysis of Macrocyclic Peptide RAS Inhibitors: Spotlight on the Solvent-Exposed Region▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acsmedchemlett.6c00122 · 📅 2026 (ACS Med. Chem. Lett., Letter) · メディシナルケミストリー
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中外製薬の Chiyoda・Tanada らによる、経口投与可能な RAS 阻害マクロ環ペプチド LUNA18(paluratide / AP2180)の構造活性相関(SAR)解析。LUNA18 は 11-mer の環状ペプチドで、KRAS を標的とする中分子(mid-size molecule)創薬の代表例である。本研究は、ペプチドの solvent-exposed(溶媒露出)領域に位置する position 5 のアミノ酸側鎖に焦点を当て、その活性寄与が分子全体の局所コンフォメーションに強く依存することを、X 線結晶構造を伴って明らかにした。
📣 中外のRAS阻害マクロ環ペプチドLUNA18のSAR解析。溶媒露出position5の活性寄与は、位置1,8,9の疎水ネットワークが作るcavity/groove構造に依存。中分子SARは局所コンフォメーション文脈で読むべきという設計原理を提示。
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9. Methods to Study the Molecular Mechanism and Drive the Design of Protein Degraders▶ スライドあり
DOI: 10.1021/acs.chemrev.5c00800 · 📅 2026年5月(Chemical Reviews, ASAP) · メディシナルケミストリー
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CroweとCiulli(Dundee大)は、標的タンパク質分解(TPD)を実現するPROTACおよび分子接着剤(molecular glue)の作用機序を段階的に評価するための実験・計算手法の包括的レビューを提供した。細胞透過性→二元結合→三元複合体形成→ユビキチン化→タンパク質分解という5段階の機序を系統的に整理し、各ステップに適した生物物理学・生化学アッセイを提示している。ハイスループットスクリーニングから原子レベルの構造解析まで、創薬の各段階に対応したメソッドを網羅したリファレンスレビューである。
📣 PROTAC・分子接着剤の作用機序を5段階で網羅した決定版レビュー。三元複合体協調性αの定量法からシャメレオニシティ評価まで創薬で使える手法が一挙に! #PROTAC #TPD #DrugDiscovery
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10. The Multifaceted Legacy of Thalidomide: Chemistry and Biology Driving Modern Drug Design▶ スライドあり
DOI: 10.1002/cmdc.202501105 · 📅 2026年(ChemMedChem 21, e202501105) · メディシナルケミストリー
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NikoviaとNeochoritis(クレタ大学)は、サリドマイドを歴史・化学・生物学の3軸から包括的に再評価した総説を提供した。1950年代の催奇形性悲劇から始まり、CRBN(セレブロン)の発見(2010年)を経て、PROTACおよびCELMoD(分子接着剤)の中核分子としての現代的再発見に至るまでの軌跡を、合成化学・SAR・薬理活性の観点から整理した。特に(1)thalidomide/lenalidomide/pomalidomideを用いた50種以上のPROTAC合成戦略、(2)TNF-α阻害のSAR、(3)FGFR阻害・抗血管新生活性、(4)CELMoD臨床開発状況を詳述している。
📣 サリドマイドの悲劇から現代PROTAC設計まで。CRBN結合の構造活性相関・4位置換則・MCR合成戦略を網羅。創薬化学の生きた教科書🧬 #PROTAC #CRBN #MedicinalChemistry
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