📚 週次論文レビュー総括レポート

対象期間: 2026-04-20 〜 2026-04-26 生成日時: 2026-04-26 各サブページで 🔧/📖/📉 を選択（複数同時ON可）

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機械学習・AI

76 本

スライドあり: 58 / 8ページ

📄 ページ1: 1〜10件 📄 ページ2: 11〜20件 📄 ページ3: 21〜30件 📄 ページ4: 31〜40件 📄 ページ5: 41〜50件 📄 ページ6: 51〜60件 📄 ページ7: 61〜70件 📄 ページ8: 71〜76件

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計算化学

35 本

スライドあり: 24 / 4ページ

📄 ページ1: 1〜10件 📄 ページ2: 11〜20件 📄 ページ3: 21〜30件 📄 ページ4: 31〜35件

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メディシナルケミストリー

9 本

スライドあり: 6 / 1ページ

📄 ページ1: 1〜9件

📋 論文一覧（先頭50件）

#	タイトル	カテゴリ	発表	スライド
1	LAMMPS-ANI: Large Scale Molecular Dynamics Simulations …	機械学習・AI	2025年（ChemRxiv プレプリント）	✅
2	BindFlow: a free, user-friendly pipeline for absolute b…	計算化学	2025年9月（bioRxiv preprint）	✅
3	Unified all-atom molecule generation with neural fields	機械学習・AI	2025年11月	✅
4	Uncertainty-Aware Multi-Objective Reinforcement Learnin…	機械学習・AI	2025年10月	✅
5	Lost in Tokenization: Context as the Key to Unlocking B…	機械学習・AI	2025年10月	✅
6	Physics–Preference Aligned Tool-Using Policies for Mole…	機械学習・AI	2025年（NeurIPS 2025 ML4PS Workshop）	✅
7	Joint Design of Protein Surface and Structure Using a D…	機械学習・AI	2025年11月（NeurIPS 2025）	✅
8	Improving protein-ligand complex generation with force …	機械学習・AI	2025年（NeurIPS 2025 Workshop SimBioChem）	✅
9	Trillion Ligands per Day: Performance-Portable Virtual …	計算化学	2025年11月（SC '25, St Louis, MO, USA）	✅
10	Integrated In Silico Pipeline for Validating AI-Generat…	計算化学	2026年（IWBBIO 2025 proceedings, LNBI 16050）	✅
11	Protocol for an automated virtual screening pipeline in…	計算化学	2025年12月	✅
12	PLNet: Persistent Laplacian Neural Network for Protein–…	機械学習・AI	2025年12月	✅
13	Modeling Protein–Small Molecule Conformational Ensemble…	機械学習・AI	2025年11月	✅
14	Resolving Data Bias Improves Generalization in Binding …	機械学習・AI	2025年	✅
15	Navigating Structure-Based Drug Discovery with Emerging…	計算化学	2025年	✅
16	Sampling Challenges of MM/PBSA Binding Energy Calculati…	計算化学	2025年10月	✅
17	MicroCycle: An Integrated and Automated Platform to Acc…	メディシナルケミストリー	2024年1月25日（J. Med. Chem. 2024, 67, 2118–2128）	✅
18	Evaluating Ligand Docking Methods for Drugging Protein–…	計算化学	2025年（J. Cheminformatics 17:144）	✅
19	Computation of Protein-Ligand Binding Free Energies wit…	計算化学	2025年3月（Accepted: March 3, 2025）	✅
20	REINFORCE-ING Chemical Language Models for Drug Discove…	機械学習・AI	2025年11月（Accepted: November 7, 2025）	✅
21	SynKit: A Graph-Based Python Framework for Rule-Based R…	計算化学	2025年11月（Accepted: November 19, 2025）	✅
22	Boosting Drug Discovery: Expanding the Applicability of…	計算化学	2025年（JCIM ASAP）	✅
23	RLMolLM: Reinforcement Learning-Enhanced Language Model…	機械学習・AI	2025年11月	✅
24	SiteMatcher: A Web Server for Structure-Based Drug Desi…	計算化学	2025年11月	✅
25	Combining AlphaFold with Focused Virtual Library Design…	メディシナルケミストリー	2025年（JCIM ASAP）	✅
26	MAPCliff-WMGR: Exploring Activity Cliffs in Molecular A…	機械学習・AI	2025年11月	✅
27	Ultra-large Library Screening with an Evolutionary Algo…	計算化学	2025年	✅
28	A Quantitative Model of Structure-Based Virtual Screeni…	計算化学	2025年	✅
29	FEP Ω: The End of Parameter Tuning	計算化学	2025年	✅
30	Benchmarking Active Learning Virtual Screening across V…	計算化学	2025年	✅
31	Rethinking Ligand Efficiency: Normalization Pitfalls, U…	メディシナルケミストリー	2025年11月	✅
32	PEGASUS: Unlocking Polarity in Cell-Permeable Cyclic Pe…	機械学習・AI	November 2025	✅
33	EDWARD: E(3)-Equivariant Dual-Way Attentive Reduction f…	機械学習・AI	December 2025	✅
34	A QM-AI Approach for the Acceleration of Accurate Asses…	計算化学	December 2025	✅
35	Improved ADME Prediction by Multitask Pretraining on Pr…	機械学習・AI	2025年（J. Chem. Inf. Model.、掲載確定）	✅
36	Descriptor-First Approach for ADMET Prediction in the P…	機械学習・AI	2026年1月（J. Chem. Inf. Model. 2026, 66, 406–412）	✅
37	BioChemAIgent: An AI-driven Protein Modeling and Dockin…	機械学習・AI	2025年12月	✅
38	A unified language model bridging de novo and fragment-…	機械学習・AI	2025年11月	✅
39	BENTO: Benchmarking Classical and AI Docking on Drug De…	計算化学	2025年12月	✅
40	The Influence of Ligands on AlphaFold3 Prediction of Cr…	機械学習・AI	2026年1月	✅
41	FlashAffinity: Bridging the Accuracy-Speed Gap in Prote…	機械学習・AI	2025年12月	✅
42	Explaining how mutations affect AlphaFold predictions	機械学習・AI	2026年1月	✅
43	SeedFold: Scaling Biomolecular Structure Prediction	機械学習・AI	2025年12月	✅
44	Apo2Mol: 3D Molecule Generation via Dynamic Pocket-Awar…	機械学習・AI	2025年11月	✅
45	SculptDrug: A Spatial Condition-Aware Bayesian Flow Mod…	機械学習・AI	2025年11月	✅
46	ReACT-Drug: Reaction-Template Guided Reinforcement Lear…	機械学習・AI	2025年12月	✅
47	MolGuidance: Advanced Guidance Strategies for Condition…	機械学習・AI	2025年12月	✅
48	Peptide2Mol: A Diffusion Model for Generating Small Mol…	機械学習・AI	2025年11月	✅
49	Diffusion Models are Molecular Dynamics Simulators	機械学習・AI	2025年11月	✅
50	MolSculpt: Sculpting 3D Molecular Geometries from Chemi…	機械学習・AI	2025年12月	✅