ESMACS（Absolute BFE）
アンサンブル10レプリカ × 4 ns。UQ付き ΔG でGALヒット同定ループを駆動。ff14SB/GAFF2/TIP3P, NAMD3。25→10レプリカでスループット確保。
TIES（Relative BFE）
MCS Tanimoto (閾値0.4) で摂動ネットワーク構築。5レプリカ × 13λウィンドウ × 4 ns = 260 ns/リガンド。AM1-BCC-ELF10電荷でコンフォーマー依存性低減。
WDR91 Compound 10 結合様式
①ベンズアミドNH ↔ Thr532主鎖CO（H結合）②ピラゾール環が Arg462 cation-π + Thr532-Lys533 アミド-π のサンドイッチ（活性クリフ原因）③Cl↔Cys503 カルコゲン結合（弱）
lib/docking → SST サロゲート統合
UniDockRunner の前段に SSTSurrogateScreener を追加。SMILES Transformer + BPE で ZINC 全体を高速スクリーニングし上位 10k のみドッキングへ送る（~1000倍効率化）。
lib/fep → ESMACS/TIES アンサンブル FE
MMGBSAEngine をアンサンブル化し UQ つき ΔG 出力を実装。10レプリカ並列実行で信頼性の高い予測を提供。DockFEP に TIES の MCS 摂動ネットワーク構築機能を追加。
lib/molgen → GAL オーケストレーター
MolgenYaml のスコアリング関数に FE フィードバックと AiZynthFinder 合成スコアを組み込み多目的 GAL ループを構築。REINVENT との連携で活性・合成容易性を同時最適化。