アルケミカル相対結合自由エネルギー（RBFE）計算は創薬の化合物優先順位付けで gold-standard だが、信頼できる実装は Schrödinger FEP+ など商用が中心で、ライセンス制約とプロトコル改変の柔軟性に難がある。オープンソース学術ソフトは permissive ライセンスで最先端だが、大規模検証・長期保守・高スループット最適化を欠きがちだった。
→ OpenFE（学界×産業界の結節点）の第一弾 RBFE プロトコルを、開発元以外の製薬15社がデフォルト設定で公開＋盲検プライベートデータに横断適用して評価
電荷変化は co-alchemical water 法で net-neutral を維持（水→対イオン, 0.8nm 以遠, 形式電荷差≤1）。HMR 3 amu・4 fs・PME。
公開58系で OpenFE 1.73（10系が sub-kcal/mol）、手動調整 FEP+ 1.20（19系）。盲検プライベート37系では 2.44 に上昇（sub-kcal/mol は2系のみ）＝実世界の難しさを反映。
誤差統計では FEP+ が一貫して優位（1 kcal/mol 内で約13pt 差）だが、2 kcal/mol 閾値では差が縮む。ランキング指標（fraction-of-best-ligand）は両者統計的に同等（Wilcoxon p=0.25）。
| 指標 | 結果 |
|---|---|
| 失敗 edge（公開） | 64 / 1245 |
| 再現性 (repeat 範囲<1 kcal) | 公開 83.5% / 私 71.7% |
| 中性 edge スループット | 5.8 ± 3.4 h |
| 電荷変化 edge | 31.0 ± 11.3 h |
| 収束（サンプリング） | 80% で概ね収束 |
| edgewise RMSE 公開 | 1.37 kcal/mol |
| edgewise RMSE 私的 | 1.93 kcal/mol |
NVIDIA L40S GPU。堅牢性・再現性・スループット・収束速度の産業利用4基準をすべて充足。